当年蒙元被追出中原后，原本精诚合作的各门各派却发生了巨大分歧，以丐帮为首的群雄主张拥护宋室，重定中原。而以少林为首的群雄却认为宋室暗弱腐朽，难堪大任。而作为当时联军三大派之一的明教，其内部也发生了极大的分歧，分裂成对立的两派，从口诛笔伐发展到兵刃相向。
当时的明教教主张无极不忍见教内兄弟相残，大感失落下，辞去教主之位，飘然远去，隐居在蜀南树海之中。
得知奇书之一的《倚天屠龙记》在张教主手中后，你决定前往树海，求取这部奇书。
来到树海，玩家首先会遇到周止若。但是，周止若突然对你下手并且毫不留情，仿佛有着深仇大恨一般。她剑法凌厉，容不得你多想，先制服她再说。
战斗开始后，周止若带着4位峨眉弟子出场。玩家可以将自己的弟子放在一边，形成方阵，集中火力先消灭2名峨眉弟子，之后就能对周止若展开攻击。周止若第1回合招式"刑天舞戚",全体增加53点攻击力；第2回合招式"龙蛇起陆"全体增加53点防御力；第三回合招式"残阳照雪"对玩家全体弟子造成伤害；第五回合招式"九阴白骨爪"提升命中率，并追加普通攻击3次。
很明显，如果玩家没有一个强力的肉盾弟子，那肯定是顶不过第5回合的"九阴白骨爪".而且石灰粉降低的命中在该招式面前实属废柴。建议玩家在2回合内清理掉2个峨眉弟子，并在第3回合施展高伤害武学，以求用最短的回合战胜周止若。剩下的2个峨眉弟子轻而易举就能杀掉。
战胜周止若后，经过一番解释后终于化解了误会。随后，跟随周止若沿着小溪向树海深处走去，穿过一片树林，突然见到一个身穿绿色衣衫的男子，这人便是青翼蝠王。蝠王对于你能战胜周止若感到有些惊讶，并想与你切磋一下。玩家可以选择将弟子分别站在前一、后一、前五、后五的位置，先打倒前方的3个树海隐士。青翼蝠王的回避较高，玩家无需恋战，只要顶住6回合即可结束战斗。
在树海深处，遇到了疯病发作的金毛狮王。
此战，玩家需要注意的是：金毛狮王两边分别带着普攻免疫和招式免疫的巨石。如果玩家在招式上设置错误，那将无法对巨石造成伤害。而金毛狮王自身所带的状态，会使他减少30%的命中和每回合损失较多的生命。玩家只要不被巨石所扰，基本可以轻松战胜他。
战胜金毛狮王后，前往青竹峰。在赶往张教主隐居的悠然居路中，你已经解决了数波暗盟高手。在紫竹亭你遇到一名白眉老僧，这人自称园真！原来此人正是"混元霹雳手"成昆，在投入少林前便是江湖上成名已久的厉害人物。对上他，还需小心谨慎为上。
成昆第一回合招式"十香软筋散"降低普攻攻击暴击率、降低造成招式伤害；第二回合施展招式"霹雳弹",使玩家全体弟子每回合生命减少1000;第5回合招式"摧肝断肠"增加500点攻击力。除了"霹雳弹"对HP较低的弟子比较有威胁外，玩家可以设置高输出招式，在短时间内结束战斗。
来到悠然居，却未发现张无极的身影，只有身中剧毒的赵敏。继续前进，发现张教主原来在凝碧崖上为赵敏寻找药材。表明来意与身份后，张教主需要你帮忙找10份定风草（侠客岛）、10份羽叶三七（药王谷）与20块木灵（蜀南竹海）.
收集完材料后，张教主答应将"倚天屠龙记"给你，但是需要比试一番。张教主在第一回合便会施展招式"乾坤一气",被攻击时使用内力抵消所受伤害，而且他的内力有1W之多。若玩家攻击不够高，难免在此挫败。玩家不妨使用减少内力的招式，来降低张教主"乾坤一气"的作用，只要该状态被破，玩家便可简单获胜。至于减少普通伤害的状态，只要使用招式攻击即可。
获胜后，可获得"倚天屠龙记".最后，只要再战胜凝碧崖左边的暗盟刺客，蜀南树海副本也就结束啦。
重要NPC:
杨肖：掉落5阶武学心得，是研发、参悟5阶武学必备道具。
张三峰：名人绝技
张三峰绝技包括：御武当，御少林，御华山，御明教，御魔教，御丐帮。
御武当效果（例）:所受武当全部攻击基础伤害减少。
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