指挥官分为自身指挥官，普通指挥官，技能指挥官，超级指挥官，特殊指挥官。这些指挥官都同有4种属性，即<精准，闪避，速度，电子>分别影响战斗中的一些数值。玩家不能同时拥有2个相同的指挥官。
自身指挥官是当玩家在游戏中建立帐号时就会生成的一个指挥官，这个指挥官的名字就是这个玩家的游戏名，不同玩家的自身指挥官的能力数值都是一样的，并且他们的成长数值也相同。
当玩家通过打怪（NPC船），对战的一些路径，将自身指挥官的等级升至20级时，会在指挥官界面中出现一个信仰按钮，供玩家来选择，选择不同的信仰会开启不同的隐藏组件/船只/建筑.(暂未开放信仰功能)。
普通指挥官是由玩家使用一定量的科技资源抽取所得的一个指挥官。普通指挥官没有任何技能以及特殊能力，它的4种基本属性也是随机的，成长数值也是随机的。给予玩家神秘性。正常玩家120分钟可以抽取一次指挥官。
跟普通指挥官一样，在花费科技点资源抽取指挥官会有非常小的几率来获得技能指挥官，技能指挥官全部都拥有技能，这些技能可以在战斗起到非常不错的辅助效果，玩家可以在抽取指挥官的过程中的惊喜，不过如果想持续的抽指挥官的话只能支付一定量的点卷，每种技能指挥官每个玩家只能拥有1个。
超级指挥官的获得方式跟技能指挥官相同，只不过几率要低的多，不过这类指挥官的能力都是最顶级的。特殊指挥官的获得方式跟技能指挥官相同。几率相对较小，这类指挥官属性或技能都非常相比技能指挥官要强大，但是不及超级指挥官。
指挥官升级所需的经验获得，指挥官的经验也就是战斗中击沉敌方船体所包含的经验。（指挥官所在的舰队每杀死一只敌船，就会获得相应的经验）。
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